地籍乃為不動產財產權之公示登記，並為土地利用與土地賦稅的基礎，而完備無誤之土地登記，為國家建設發展之基石，亦為人民財產權保障之表現。然以台灣光復初期辦理總登記時，由於當時人民不諳我國法令，且地政機關人員法制觀念未臻健全，致遺留有以日據時期會社、組合、神明會或其他不明主體之名義申報登記之土地，或有以日據時期不動產物權名稱申報登記之土地權利、共有土地各共有人登記之權利範圍錯誤，登記名義人登記之姓名、名稱或住址記載不全或不符，寺廟及宗教團體土地產權未能妥適解決等情形，而該等地籍登記不完整或與現行法令規定不符之問題，遺存至今，已長達60多年，嚴重影響土地利用、土地賦稅及民眾財產權之行使。本條例公布前雖曾先後訂頒多種處理要點清理，然該等處理要點均屬行政命令，實施以來成效有限且待全面清理。

為澈底解決該等地籍問題，爰於96年3月21日制定公布「地籍清理條例」，行政院定自97年7年1日起施行，又考量待清理之筆數眾多，須耗費大量人力、物力辦理，故由內政部擬具「地籍清理實施計畫」(以下簡稱前期計畫，期程自97年至102年)，報奉行政院96年11月27日核定，99年4月14日核定修正，並據以推動相關清理工作。又至前期計畫結束(102年底)時，預估仍有部分土地之權利人尚未提出申報或申請登記，部分土地仍未完成代為標售作業，均待繼續推動清理；此外，於清理過程中，相關機關(單位)及縣市政府並反映有其他地籍問題(如早期登記之登記名義人登記資料未記載統一編號)，因不利土地賦稅及其他行政業務之推動，亦亟待進行清理，爰內政部再具「地籍清理第2期實施計畫」，賡續辦理相關地籍清理工作（行政院102年5月21日院臺建字第1020030191號函核定地籍清理第2期實施計畫。）辦理期程自103年1月1日起至108年12月31日止。